L’Organe est une autorité administrative indépendante, il comprend un Conseil de veille et d’évaluation et des structures administratives.
Le Conseil de veille d’évaluation est composé d’un président et de six membres désignés par décret présidentiel pour une durée de 5 ans renouvelable une seule fois.
L’organe comporte des structures administratives, comprenant un secrétariat général et trois divisions :

  • une division chargée de la documentation, des analyses et de la sensibilisation ;
  • une division chargée du traitement des déclarations de patrimoine ;
  • une division chargée de la coordination et de la coopération internationale »

L’ONPLC ne travaille pas en vase clos, il peut «  solliciter le concours de toute administration, institution ou organisme public dans le domaine de la prévention et de la lutte contre la corruption.
Il peut, également, faire appel à tout expert, consultant ou organisme d'études susceptible de l'assister dans ses travaux conformément à la réglementation en vigueur.
« L'organe prend toutes recommandations, tous avis, rapports ou études qu'il transmet aux structures concernées, conformément aux dispositions législatives et réglementaires en vigueur» (article 18).
Les ressources financières de l’Organe proviennent exclusivement du budget de l’État. .